La méthode naturelle de Reiki a été fondée au Japon par Mikao Usui (né en 1865). Celui-ci, lors d'une retraite de 21 jours sur le Mont Kurama (au Nord de Kyoto), a été touché par une énergie intense. Il a pu ensuite canaliser cette énergie. Puis Il créa une méthode de développement personnel, spirituel et par extension, de bien être.  

Il l'utilisa d'abord pour lui même, et donna par la suite des séances, et conçut un enseignement. Lors du tremblement de terre de Kobé en 1923, Mikao Usui se fit connaitre en prenant soin des survivants avec ses élèves.

Le Reiki connut alors une grande notoriété,  et se diffusa très vite au Japon, et au-delà. A son décès, il y avait 2 000 élèves, de nombreux maîtres-enseignants, et 70 Écoles d'enseignements.

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